食品安全檢測儀主要是用來檢測、檢驗和分析食品中有毒、有害物質，現有的食品安全檢測儀主要有以下幾類:

食品安全檢測儀轉基因產品檢測儀器:主要方法包括基因轉錄水平和基因水平的檢測，主要使用離心機等制備基因樣品的設備，用基因擴增儀(PCR)和酶標儀、電泳系統(tǒng)等進行分離、分析和檢測的儀器。

食品安全檢測儀微生物毒素檢測儀器:目前使用較多的是酶標儀、薄層色譜儀、黃曲霉素測定儀等，內源毒素類可用液相色譜儀或分光光度計檢測;近年來海洋生物毒素的檢測廣泛運用液相色譜儀以及 CE 和 CE–MS 聯用儀檢測。

食品安全檢測儀樣品前期處理的儀器:食品安全分析、檢驗是在極復雜的樣品中進行檢測，只有微量的殘留物和污染物，采用傳統(tǒng)的樣品前期處理儀器會使測量精度大大降低，甚至無法檢測出污染物濃度，因此必須采用新技術生產的樣品前期處理儀器設備，目前使用較多的如固相萃取儀(SPE)、凝膠滲析萃取儀(GPC)、基質固相分散萃取儀(MSPDE)、固相微萃取儀(SPME)、超臨界萃取儀(sFE)等新儀器。